A farmácia de Medicamentos Especiais funciona das 8h às 15h, atendendo cerca de mil pacientes por mês. As substâncias oferecidas estão de acordo com os Protocolos Clínicos de Diretrizes Terapêuticas (PCDT) do Ministério da Saúde. O paciente deve abrir processo administrativo junto à assistência farmacêutica do Estado, via sistema de Administração de Medicamentos (AME), para ter acesso aos remédios. Mais informações pelo site
https://farmaciadigital.rs.gov.br ou diretamente no setor. A farmácia ainda oferece o programa municipal de fraldas, bastando apresentar receita e possuir renda familiar bruta inferior a três salários mínimos.